Show simple item record

Microbiological diagnostics: From traditional to molecular genetic methods: A literature review

Мікробіологічна діагностика: від традиційних до молекулярно-генетичних методів: огляд літератури

dc.creatorІвашко, Максим
dc.creatorБурмей, Світлана
dc.creatorЮсько, Леся
dc.creatorЧайковська, Тетяна
dc.creatorБойко, Надія
dc.date2023-12-22
dc.date.accessioned2026-07-07T10:20:35Z
dc.date.available2026-07-07T10:20:35Z
dc.identifierhttps://ojs.tdmu.edu.ua/index.php/bmbr/article/view/16201
dc.identifier10.61751/bmbr/4.2023.34
dc.identifier.urihttps://repository.tdmu.edu.ua//handle/123456789/30615
dc.descriptionThe development of new and optimisation of known cultural and molecular genetic methods for accuratespecies identification of microorganisms is an urgent and practically necessary task that is receiving great attentionfrom researchers. The purpose of this study was to analyse and systematise theoretical scientific data on methods ofmicrobial identification and assess their main advantages and disadvantages. For this purpose, a systematic review of53 randomised research papers published between 2018 and 2023 was conducted. The search for publications using thekeywords “microbiome”, “microbiological diagnostics”, “identification of microorganisms”, “sequencing”, and “omicstechnologies” in the title or text of the research paper was carried out in Web of Science, Scopus, PubMed, and GoogleScholar. The study provides generalised information on traditional and modern methods of microbial identification. Itis established that the advantages of traditional diagnostic methods include the possibility of preserving the obtainedmicroorganisms for further research, in particular, for determining their antibiotic sensitivity. Modern molecular genetic methods open up new possibilities for the accurate identification of microorganisms, including those that aredifficult to incubate using traditional cultural methods. The use of these methods allows obtaining detailed data on thegenetic structure and diversity of microorganisms, which is important in many fields, including microbiology, medicine,and ecology. However, molecular methods are more sensitive to contamination or errors in the sample collectionand processing. Moreover, omics technologies (genomics, transcriptomics, proteomics, and metabolomics) open upnew opportunities for studying cells at more complex levels of life organisation. In everyday clinical practice, themicrobiological method of isolating microbial cultures remains the main one, as it is the only one that allows determiningnot only the cause of the infection but also the antibiotic sensitivity. However, cultural methods for studying fastidiousmicroorganisms are quite limited. Thus, the results obtained contribute to the development of fast and accuratemethods for identifying, classifying, and systematising microorganisms, which facilitates the processes of diagnosis anddevelopment of strategies for the control and treatment of infectious diseases in laboratories and clinical institutions Received: 02.08.2023 | Revised: 16.10.2023 | Accepted: 28.11.2023en-US
dc.descriptionРозробка нових та оптимізація відомих культуральних та молекулярно-генетичних методів для точної видової ідентифікації мікроорганізмів є актуальним і практично необхідним завданням, якому приділяється велика увага дослідників. Метою даної роботи було проведення аналізу, систематизація теоретичних наукових даних щодо методів ідентифікації мікроорганізмів та оцінка їхніх основних переваг і недоліків. Для цього було здійснено систематичний огляд рандомізованих 53 наукових робіт, опублікованих в період з 2018 по 2023 роки. Пошук публікацій із використанням ключових термінів «мікробіом», «мікробіологічна діагностика», «ідентифікація мікроорганізмів», «секвенування» та «омікс-технології» у назві чи тексті науково-дослідницької роботи здійснювали в системах Web of Science, Scopus, PubMed та Google Scholar. У статті надано узагальнену інформацію щодо традиційних та сучасних методів ідентифікації мікроорганізмів. Встановлено, що до переваг традиційних методів діагностики належить можливість збереження отриманих мікроорганізмів для подальших досліджень, зокрема для визначення їх чутливості до антибіотиків. Сучасні молекулярно-генетичні методи відкривають нові можливості для точної ідентифікації мікроорганізмів, зокрема тих, які складно культивувати за допомогою традиційних культуральних методів. Використання цих технік дозволяє отримати детальні дані про генетичну структуру та різноманіття мікроорганізмів, що є важливим у багатьох галузях, включаючи мікробіологію, медицину та екологію. Проте, молекулярні методи більш чутливі до забруднень чи похибок у процесі збирання та обробки зразків. Варто також відмітити omics-технології (геноміка, транскриптоміка, протеоміка та метаболоміка), які відкривають нові можливості для дослідження клітин на більш складних рівнях організації життя. В повсякденній клінічній практиці основним залишається мікробіологічний метод виділення мікробних культур, оскільки тільки він дозволяє визначити не лише причину інфекції, але й чутливість до антибіотиків. У той же час культуральні методи дослідження вибагливих мікроорганізмів досить обмежені. Таким чином, отримані результати сприяють розробці швидкої та точної методики ідентифікації, класифікації та систематизації мікроорганізмів, що полегшує процеси діагностики та розробки стратегій контролю і лікування інфекційних захворювань у лабораторіях та клінічних установах Отримано: 02.08.2023 | Переглянуто: 16.10.2023 | Прийнято: 28.11.2023uk-UA
dc.formatapplication/pdf
dc.languageeng
dc.publisherTernopil National Medical Universityuk-UA
dc.relationhttps://ojs.tdmu.edu.ua/index.php/bmbr/article/view/16201/14826
dc.rightsАвторське право (c) 2026 Вісник медичних і біологічних дослідженьuk-UA
dc.rightshttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0uk-UA
dc.sourceBulletin of Medical and Biological Research; No. 4 (2023): Bulletin of Medical and Biological Research; 34-41en-US
dc.sourceВісник медичних і біологічних досліджень; № 4 (2023): Вісник медичних і біологічних досліджень; 34-41uk-UA
dc.source2706-6290
dc.source2706-6282
dc.subjectмікробіологіяuk-UA
dc.subjectдіагностикаuk-UA
dc.subjectпоживне середовищеuk-UA
dc.subjectідентифікаціяuk-UA
dc.subjectсеквенуванняuk-UA
dc.subjectомікс-технологіїuk-UA
dc.subjectmicrobiologyen-US
dc.subjectdiagnostics]en-US
dc.subjectnutrient mediumen-US
dc.subjectidentificationen-US
dc.subjectsequencingen-US
dc.subjectomics technologiesen-US
dc.titleMicrobiological diagnostics: From traditional to molecular genetic methods: A literature reviewen-US
dc.titleМікробіологічна діагностика: від традиційних до молекулярно-генетичних методів: огляд літературиuk-UA
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion


Files in this item

FilesSizeFormatView

There are no files associated with this item.

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record