Показати скорочений опис матеріалу
MODERNIZATION OF CYTOCHROME P450 CLASSIFICATION BASED ON A STRUCTURE-FUNCTION APPROACH
МОДЕРНІЗАЦІЯ КЛАСИФІКАЦІЇ ЦИТОХРОМІВ P450 НА ОСНОВІ СТРУКТУРНО-ФУНКЦІОНАЛЬНОГО ПІДХОДУ
| dc.creator | Головенко, М. Я. | |
| dc.date | 2025-03-25 | |
| dc.date.accessioned | 2026-07-06T11:11:03Z | |
| dc.date.available | 2026-07-06T11:11:03Z | |
| dc.identifier | https://ojs.tdmu.edu.ua/index.php/MCC/article/view/15520 | |
| dc.identifier | 10.11603/mcch.2410-681X.2025.i2.15520 | |
| dc.identifier.uri | https://repository.tdmu.edu.ua//handle/123456789/30247 | |
| dc.description | Introduction. Cytochromes P450 (CYPs) are key enzymes involved in the metabolism of xenobiotics and endogenous compounds. Traditionally, they are classified according to genetic origin, amino acid sequence, and family affiliation. However, rapid advancements in structural bioinformatics, pharmacophore modeling, and metabolomics offer a new perspective in which enzymes are viewed as structure-functional units of chemical recognition. Objective. To critically analyze the updated classification of CYPs, taking into account current data on their spatial organization and dynamic properties, which determine ligand interaction specificity, catalytic mechanisms, and the variability of substrate and metabolite transport channels. Methods. A comprehensive analysis of scientific publications focused on CYP classification, structural features, and functional characteristics was conducted. Sources of information included peer-reviewed articles from databases such as PubMed, Scopus, and Web of Science, as well as structural data from the Protein Data Bank (PDB), patent literature, and open-access chemical and biological databases (ChEMBL, DrugBank). Results and Discussion. The study confirms the necessity for an updated classification that incorporates a functional CYP system characterizing the enzyme's catalytic reactions. The structural component of this system categorizes CYPs based on molecular architecture, topology, conformational flexibility, oligomerization mechanisms, membrane interactions, and structure-determined functions. Conclusions. Existing publications and models highlight the potential of a structure-function-based classification to enhance the integration of structural, biochemical, and evolutionary data, thereby creating a more objective and informative system that goes beyond traditional sequence-based analysis of CYPs. This approach is expected to become a valuable tool in pharmacology and personalized medicine. | en-US |
| dc.description | Вступ. Цитохроми P450 (CYP) є ключовими ензимами метаболізму ксенобіотиків та ендогених сполук. Традиційно їх класифікують за генетичним походженням, амінокислотною послідовністю та родинною належністю. Проте стрімкий розвиток структурної біоінформатики, фармакофорного моделювання та метаболоміки відкриває нову перспективу, де ферменти розглядаються як структурно-функціональні одиниці хімічного розпізнавання. Мета дослідження – критичний аналіз оновленої класифікації CYP з урахуванням сучасних даних їх просторової організації, динамічних властивостей, які визначають специфічність взаємодії з лігандами, механізми каталітичної дії та варіабельність каналів транспорту субстратів і метаболітів. Методи дослідження. Для підготовки дослідження проведено всебічний аналіз наукових публікацій, присвячених класифікації CYP, їх структурним особливостям та функціональним характеристикам. Джерелами інформації слугували рецензовані наукові статті з баз даних PubMed, Scopus, Web of Science, а також структурні дані з Protein Data Bank (PDB), патентні матеріали та відкриті хімічні й біологічні бази даних (ChEMBL, DrugBank). Результати й обговорення. Підтверджена необхідність оновленої класифікації, де складником є функціональна система CYP, яка характеризує каталітичні реакції ферменту. Структурна частина цієї системи розподіляє CYP за архітектонікою молекули, її топологією, конформаційною гнучкістю, механізмами олігомеризації, взаємодією з мембранами, а також структурно зумовленими функціями. Висновки. Наявні публікації та моделі свідчать про потенціал структурно-функціональної класифікації у покращенні інтеграції структурної, біохімічної та еволюційної інформації для створення більш об’єктивної та інформативної системи, яка виходить за межі традиційного послідовнісного аналізу CYP. Очікується, що вона може стати важливим інструментом у фармакології та персоналізованій медицині. | uk-UA |
| dc.format | application/pdf | |
| dc.language | ukr | |
| dc.publisher | Ternopil National Medical University | uk-UA |
| dc.relation | https://ojs.tdmu.edu.ua/index.php/MCC/article/view/15520/14284 | |
| dc.rights | Авторське право (c) 2025 Медична та клінічна хімія | uk-UA |
| dc.rights | https://creativecommons.org/licenses/by/4.0 | uk-UA |
| dc.source | Medical and Clinical Chemistry; No. 2 (2025); 5-17 | en-US |
| dc.source | Медицинская и клиническая химия; № 2 (2025); 5-17 | ru-RU |
| dc.source | Медична та клінічна хімія; № 2 (2025); 5-17 | uk-UA |
| dc.source | 2414-9934 | |
| dc.source | 2410-681X | |
| dc.source | 10.11603/mcch.2410-681X.2025.i2 | |
| dc.subject | cytochromes P450; classification; structure-function approach; ligands; specificity; pharmacology; toxicology; biotechnology. | en-US |
| dc.subject | цитохроми P450; класифікація; структурно-функціональний підхід; ліганди; специфічність; фармакологія; токсикологія; біотехнологія. | uk-UA |
| dc.title | MODERNIZATION OF CYTOCHROME P450 CLASSIFICATION BASED ON A STRUCTURE-FUNCTION APPROACH | en-US |
| dc.title | МОДЕРНІЗАЦІЯ КЛАСИФІКАЦІЇ ЦИТОХРОМІВ P450 НА ОСНОВІ СТРУКТУРНО-ФУНКЦІОНАЛЬНОГО ПІДХОДУ | uk-UA |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/article | |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
Долучені файли
| Файл | Розмір | Формат | Переглянути |
|---|---|---|---|
|
Даний матеріал не має долучених файлів. |
|||