PHARMACOPHORE MODELING OF 3,5-DISUBSTITUTED DERIVATIVES OF (4-METHYL/R-PHENYL-3H-THIAZOL-2-YLIDENE)-R1-PHENYL/CYCLOHEXILAMINES WITH CARDIOPROTECTIVE ACTIVITY
ФАРМАКОФОРНЕ МОДЕЛЮВАННЯ РЯДУ 3,5-ДИЗАМІЩЕНИХ ПОХІДНИХ (4-МЕТИЛ/R-ФЕНІЛ-3H-ТІАЗОЛ-2-ІЛІДЕН)-R1-ФЕНІЛ/ЦИКЛОГЕКСИЛ-АМІНІВ ІЗ КАРДІОПРОТЕКТОРНОЮ АКТИВНІСТЮ
| dc.creator | Drapak, I. V. | |
| dc.date | 2019-03-27 | |
| dc.date.accessioned | 2020-02-26T12:46:13Z | |
| dc.date.available | 2020-02-26T12:46:13Z | |
| dc.identifier | https://ojs.tdmu.edu.ua/index.php/pharm-chas/article/view/9923 | |
| dc.identifier | 10.11603/2312-0967.2019.1.9923 | |
| dc.identifier.uri | https://repository.tdmu.edu.ua/handle/123456789/15161 | |
| dc.description | The aim of the work. Pharmacophore modeling for 3,5-disubstituted derivatives of (4-methyl/R-phenyl-3H-thiazol-2-ylidene)-R’-phenyl/cyclohexilamines with established cardioprotective activity. Materials and Methods. The 3,5-disubstituted derivatives of (4-methyl/R-phenyl-3H-thiazol-2-ylidene)-R’-phenyl/cyclohexilamines with established cardioprotective activity were objects of the study. The Molecular Operating Environment (MOE) version 2007.09 was used for pharmacophore simulations. The force field MMFF94x was used in the modeling. The geometry optimization of the conformers was carried out by a stochastic search method. Results and Discussion. The 8 models were developed and characterized by different composition, accuracy of classification and coordinates of pharmacophore centers. The presence of hydrogen bond acceptors and hydrophobic regionsin the active molecules play a key role in all models. The established pharmacophore model contains two pairs of pharmacophore centers located on opposite edges and one hydrophobic region located near the center of the pharmacophor. Each of these pairs is formed from closely spaced (2.85 and 3.79 Å distances respectively) of the hydrophobic pharmacophoric center and the projection of a hydrogen bond donor. Conclusions. The possible pharmacophore which consists from three hydrophobic regions and two projections of hydrogen bond acceptors was identefied in the pharmacophore modeling for 3,5-disubstituted derivatives of (4-methyl/R-phenyl-3H-thiazol-2-ylidene)-R’-phenyl/cyclohexilamines with investigated in vivo cardioprotective properties The accuracy of the classification of active and inactive compounds by this model is 0.73. The hypothesis about the participation of the acethyl group, the imino group and possibly the distal Nitrogen atom of piperazine moiety in conjunction with the amino acids – hydrogen exchange biotargets was advanced on the basis of the analysis of the compound conformation with the highest cardioprotective activity. The resulting pharmacophore model will be further used for in silico screening molecular databases to identify virtual hits and purposefully search for new cardioprotectors. | en-US |
| dc.description | Мета роботи. Фармакофорне моделювання для ряду 3,5-дизаміщених похідних (4-метил/R-феніл-3H-тіазол-2-іліден)-R1-феніл/циклогексил-амінів із встановленими кардіопротекторними властивостями. Матеріали і методи. Об’єктами дослідження були 3,5-дизаміщені похідні (4-метил/R-феніл-3H-тіазол-2-іліден)-R1-феніл/циклогексил-амінів із встановленою кардіопротекторною активністю. Фармакофорне моделювання проводили в програмному середовищі для обчислювальних хімічних досліджень Molecular Operating Environment (MOE) версії 2007.09. У даному дослідженні використовували силове поле MMFF94x, оптимізацію геометрії конформерів проводили методом стохастичного пошуку. Результати й обговорення. У процесі фармакофорного моделювання розроблено 8 моделей, які характеризуються різним складом та координатами фармакофорних центрів, а також точністю класифікації. У всіх моделях ключову роль відіграють наявні в активних молекулах акцептори водневого зв’язку та гідрофобні області. Створена фармакофорна модель містить дві пари фармакофорних центрів, які знаходяться на протилежних краях та однієї гідрофобної області розташованої біля центру фармакофора. Кожна з цих пар сформована з близько розташованих (відстані 2,85 та 3,79 Å відповідно) гідрофобного фармакофорного центру та проекції донора водневого зв’язку. Висновки. Проведене фармакофорне моделювання ряду 3,5-дизаміщених похідних (4-метил/R-феніл-3H-тіазол-2-іліден)-R1-феніл/циклогексил-амінів з дослідженими in vivo кардіопротекторними властивостями дало змогу виділити можливий фармакофор, що складається із трьох гідрофобних областей та двох проекцій акцепторів водневого зв’язку. Точність класифікації активних та неактивних сполук даною моделлю становить 0,73. На основі аналізу узгодженої з фармакофорною моделлю конформації сполуки з найбільшою кардіопротекторною активністю висунуто гіпотезу про участь ацетильної групи, іміно-групи та можливо дистального атома Нітрогену піперазинового фрагменту у взаємодії з амінокислотами – донорами Гідрогену біомішені. Подальші дослідження потрібні для ідентифікації біомішені, відповідальної за прояв кардіопротекторних властивостей. Одержана фармакофорна модель буде в подальшому використовуватись для in silico скринінгу молекулярних баз даних з метою ідентифікації віртуальних хітів та цілеспрямованого пошуку нових кардіопротекторів. | uk-UA |
| dc.format | application/pdf | |
| dc.language | ukr | |
| dc.publisher | Тернопільський державний медичний університет імені І. Я. Горбачевського МОЗ України | uk-UA |
| dc.relation | https://ojs.tdmu.edu.ua/index.php/pharm-chas/article/view/9923/9531 | |
| dc.rights | Авторське право (c) 2019 Фармацевтичний часопис | uk-UA |
| dc.rights | https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0 | uk-UA |
| dc.source | Pharmaceutical Review; No. 1 (2019); 11-18 | en-US |
| dc.source | Фармацевтичний часопис; № 1 (2019); 11-18 | uk-UA |
| dc.source | 2414-9926 | |
| dc.source | 2312-0967 | |
| dc.source | 10.11603/2312-0967.2019.1 | |
| dc.subject | pharmacophore modeling | en-US |
| dc.subject | polysubstituted thiazole derivatives | en-US |
| dc.subject | cardioprotective activity | en-US |
| dc.subject | фармакофорне моделювання | uk-UA |
| dc.subject | 3,5-дизаміщені похідні (4-метил/R-феніл-3H-тіазол-2-іліден)-R1-феніл/циклогексил-амінів | uk-UA |
| dc.subject | кардіопротекторна активність | uk-UA |
| dc.title | PHARMACOPHORE MODELING OF 3,5-DISUBSTITUTED DERIVATIVES OF (4-METHYL/R-PHENYL-3H-THIAZOL-2-YLIDENE)-R1-PHENYL/CYCLOHEXILAMINES WITH CARDIOPROTECTIVE ACTIVITY | en-US |
| dc.title | ФАРМАКОФОРНЕ МОДЕЛЮВАННЯ РЯДУ 3,5-ДИЗАМІЩЕНИХ ПОХІДНИХ (4-МЕТИЛ/R-ФЕНІЛ-3H-ТІАЗОЛ-2-ІЛІДЕН)-R1-ФЕНІЛ/ЦИКЛОГЕКСИЛ-АМІНІВ ІЗ КАРДІОПРОТЕКТОРНОЮ АКТИВНІСТЮ | uk-UA |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/article | |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
Files in this item
| Files | Size | Format | View |
|---|---|---|---|
|
There are no files associated with this item. |
|||